Filtreringssystemet til Gulvstøvsuger spiller en avgjørende rolle for å forhindre sekundær forurensning.
Gulvstøvsugerfiltreringssystemet av høy kvalitet tar i bruk flere filtreringsteknologier. Vanlige er primærfiltrering, som vanligvis er et filter eller filterbomull, som kan filtrere ut store partikler av støv og rusk, som hår, rusk osv. Dette er den første forsvarslinjen mot sekundær forurensning. For eksempel kan hovedfilteret til noen støvsugere effektivt fange opp større partikler som er synlige for det blotte øye, og redusere belastningen av påfølgende filtreringskoblinger.
Neste er det høyeffektive filterlaget, for eksempel HEPA. Den kan filtrere små støvpartikler nøyaktig, og filtreringseffektiviteten for partikler på 0,3 mikron og over kan være så høy som 99,97 % eller enda høyere. Dette betyr at nesten alt skadelig støv som suges inn i støvsugeren kan fanges opp og ikke slippes ut i luften igjen, og unngår dermed forurensning av inneluft og skade på luftveiene hos mennesker.
Noen støvsugere bruker også filterlag med aktivt kull, som kan absorbere lukt og skadelige gassmolekyler, som formaldehyd og benzen. Spesielt ved rengjøring av kjæledyrhår, fuktige miljøer eller områder med lukt, kan det aktive kullfilterlaget effektivt fjerne lukt, gjøre den utslitte luften friskere, forbedre renseeffekten ytterligere og forhindre sekundær forurensning forårsaket av lukt og skadelige gasser.
I tillegg har filtreringssystemet til noen avanserte gulvstøvsugere også en selvrensende funksjon. Under driften av støvsugeren renses støvet på filternettet i tide gjennom omvendt luftstrøm eller vibrasjon, opprettholder permeabiliteten og filtreringseffektiviteten til filternettet, og unngår reduksjonen i sug og sekundær forurensning forårsaket av filterblokkering. For eksempel kan noen støvsugere med syklonseparasjonsteknologi separere støv fra filternettet gjennom sterk sentrifugalkraft under filtreringsprosessen og slippe det ned i støvoppsamlingsbøtten, noe som sikrer at filtreringssystemet alltid holder en god arbeidstilstand.